يتولى مجلس الإدارة مسؤولية تحديد التوجهات العامة ووضع رؤية الهيئة ورسالتها وتحديد أهدافها، كما يتولى الإشراف العام واعتماد الخطط الاستراتيجية ومراقبة الأداء.
سمو الشيخ حمدان بن زايد آل نهيان
ممثل الحاكم في منطقة الظفرة
رئيس مجلس إدارة هيئة البيئة - أبوظبي
معالي محمد أحمد البواردي
وزير الدولة لشؤون الدفاع
نائب رئيس مجلس الإدارة، رئيس اللجنة التنفيذية لهيئة البيئة – أبوظبي
معالي د. مغير خميس الخييلي
رئيس دائرة تنمية المجتمع
معالي اللواء ركن طيار فارس خلف المزروعي
القائد العام لشرطة أبوظبي
معالي محمد علي الشرفاء
رئيس دائرة البلديات والنقل
معالي مصبح الكعبي
الرئيس التنفيذي لقطاع الاستثمار في الإمارات التابع لشركة مبادلة